省医师协会常务理事孙良丹教授团队在国际著名学术期刊Genome research(IF:11.1)发表了题为“Deep sequencing of 1,320 genes reveals the landscape of protein-truncating variants and their contribution to psoriasis in 19,973 Chin - 协会动态 - 安徽省医师协会
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省医师协会常务理事孙良丹教授团队在国际著名学术期刊Genome research(IF:11.1)发表了题为“Deep sequencing of 1,320 genes reveals the landscape of protein-truncating variants and their contribution to psoriasis in 19,973 Chin

发布时间:2021-06-28 10:11:56来源:管理员 阅读:

   6月21日,安徽省医师协会常务理事孙良丹教授团队在国际著名学术期刊Genome research(IF:11.1)发表了题为“Deep sequencing of 1,320 genes reveals the landscape of protein-truncating variants and their contribution to psoriasis in 19,973 Chinese individuals”的研究论文。该研究通过对近2万例银屑病患者及对照样本1320个基因的深度测序与分析,绘制了首个大规模中国人群蛋白截断突变图谱,并揭示了此类突变对银屑病发病机制的重要影响,为复杂疾病的遗传机制研究和治疗干预提供了新的思路。
   此次研究深入分析了10539名健康对照者和9434名银屑病患者中1320个基因上的PTVs特征,共鉴定了8720个PTV,其中77%是之前从未报道过的,显示其高度的人群特异性。研究人员通过新型算法,发现88%的PTV是有害的且受到净化选择的影响,显示了自然选择对人类遗传变异的塑造与影响。论文中还对所有鉴定得到的PTV进行了详细的分类与解析,据此绘制了首个中国人群蛋白截断突变图谱,完善了该领域的“中国拼图”。
   该研究发现,与对照组相比银屑病患者携带的PTV更多(P=0.02),显示其对疾病发生机制的重要影响。研究人员还通过对中、欧、非三大人群的比较,鉴定出18个在不同人群中分化水平极高的PTV,并推测其可能受到正向选择作用,进一步凸显了PTV的人群特异性特征。
   孙良丹教授团队长期致力于疾病遗传学和转化医学研究,解析疾病基因组变异图谱,先后发现银屑病易感基因单核苷酸变异、拷贝数变异、编码变异、HLA变异和插入缺失变异,系统阐释银屑病遗传易感性机制和遗传学病因,为疾病精准医学研究提供基础。本次研究构建中国人群蛋白截断突变图谱,进一步丰富了银屑病遗传变异基础,扩展了对于蛋白截断变异人群特异性的认识,对中国人群的起源与演化以及疾病遗传机制的研究具有重要意义。

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https://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.267963.120


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